Obecność ciał obcych, kamieni lub objawy niedrożności jelita można zobaczyć w prześwietleniu jamy brzusznej promieniami RTG. Badanie to pozwala też po wcześniejszym podaniu środka kontrastowego na ocenę jelita (głównie grubego). Jest to tak zwany wlew doodbytniczy.
Wnętrze przewodu pokarmowego można obejrzeć dzięki fiberoskopom czyli giętkim rurom zakończonym kamerą. W zależności od budowy pozwalają oglądać różne odcinki przewodu pokarmowego. Przełyk, żołądek i dwunastnicę można ocenić gastroskopem który wyposażony o dodatkowe urządzenia pozwala "zajrzeć" do dróg żółciowych (ECPW - endoskopowa cholangiografia wsteczna). Esicę, czyli końcowy odcinek jelita grubego można obejrzeć sigmoidoskopem a całe jelito grube kolonoskopem.
Założenie zwykłej rurki tak zwanej sondy żołądkowej, pozwala na badanie treści pokarmowej.
W wykrywaniu nowotworów jelita grubego pomocne jest badanie kału w poszukiwaniu krwi przy pomocy testu na krew utajoną.
